Rusunawa Unimus terletak di kampus 1 Kedungmundu Raya difungsikan sebagai pondok pesantren putri dengan nama Pondok Pesantren Putri Syahlan Rosjidi dan pondok pesantren putra.
Selain itu Unimus juga memiliki Pondok Pesantren Tahfidz Qur’an Putra yang berlokasi di Jl. B Cempaka Raya No. 404 RT 13/RW 19 Perumas Sendangmulyo, Tembalang, Kota Semarang yang ditujukan untuk mahasiswa yang ingin memperdalam hafalam Al Quran.
